Après une formation scientifique pluridisciplinaire à l'École Polytechnique, Lydia a obtenu en 2010 un doctorat en microbiologie sous la direction de François Taddei. Durant sa thèse, en collaboration avec l'équipe de S. Jun, elle a développé un dispositif microfluidique, désormais appelé « machine mère », permettant pour la première fois l'observation microscopique de bactéries se développant dans des conditions contrôlées, à l'échelle de la cellule unique et sur une longue période.

Après avoir été titularisée à l'INRAE, Lydia a travaillé au Laboratoire Jean Perrin (Sorbonne Université) de 2010 à 2020, avant de rejoindre l'Institut Micalis. Elle y développe de nouvelles approches quantitatives pour aborder des questions fondamentales en biologie, en utilisant les bactéries comme organismes modèles. Ces approches combinent des expériences sur cellule unique, basées sur la microfluidique et la microscopie, et des développements théoriques issus du calcul des probabilités et de la physique statistique.

Depuis 2014, elle travaille sur la mutagenèse, un processus cellulaire important qui était resté jusqu'alors inaccessible aux études sur cellule unique, faute d'outils appropriés. En collaboration avec Marina Elez, elle a développé de tels outils et a suivi pour la première fois la dynamique des mutations ponctuelles spontanées et leurs effets chez E. coli, au niveau de la cellule unique.

Marianne a obtenu son doctorat en 2005, portant sur l'étude comparative des stratégies de reproduction des bactériophages infectant la bactérie Escherichia coli. Depuis, elle s'intéresse au décryptage des mécanismes moléculaires et des pressions évolutives qui pilotent l'évolution des phages, menant des recherches à l'interface de la génétique, de l'évolution expérimentale et de l'écologie.

Après un post-doctorat au sein du laboratoire de Nadine Cerf-Bensussan (laboratoire d'immunologie de la muqueuse intestinale, Faculté de médecine René Descartes, Paris), où elle a étudié les pressions évolutives auxquelles les bactéries sont confrontées dans l'environnement intestinal, elle est devenue chercheuse titulaire en 2012 à l'INRAE, au sein de l'équipe Phage. Elle a mené des recherches sur la coévolution des phages et des bactéries dans le microbiote intestinal et a mis en évidence l'effet néfaste des prophages dans l'intestin en raison de leurs fréquentes réactivations.

Depuis 2019, en collaboration avec Marina Elez, elle étudie les mécanismes expliquant pourquoi les phages présentent un taux de mutation cent fois supérieur à celui de leur hôte bactérien, même lorsqu'ils utilisent la machinerie de réplication de ce dernier. Par ailleurs, elle participe activement au collectif Labos1p5 (https://labos1point5.org/), qui rassemble des chercheurs œuvrant à comprendre et à réduire l'impact environnemental de la recherche.

Marina Elez est née à Split, en Croatie. Elle a obtenu sa licence en biologie moléculaire à l'Université de Zagreb. Ses recherches portent principalement sur la compréhension des mécanismes par lesquels les cellules maintiennent la stabilité de leur génome tout en assurant une certaine diversification, ainsi que sur le contrôle de cet équilibre subtil.

Elle a obtenu son doctorat en microbiologie et virologie au sein du laboratoire du professeur Miroslav Radman, à l'INSERM, Université Paris Descartes. Durant son post-doctorat dans ce même laboratoire, elle a développé la première méthode d'étude des mutations à l'échelle de la cellule unique. En 2012, elle a été nommée maître de conférences à l'Université d'Évry-Val-d'Essonne et a rejoint l'Institut de biologie des systèmes et de biologie synthétique du CNRS.

Depuis 2014, elle mène une activité de recherche indépendante, en collaboration avec Lydia Robert, au Laboratoire Jean Perrin de l'Université de la Sorbonne. Leurs travaux portent sur l'étude des processus liés à l'évolution et au maintien du génome, grâce à l'imagerie cellulaire en temps réel, la microfluidique et l'utilisation d'Escherichia coli comme organisme modèle. En 2020, elle a été nommée directrice de recherche à l'INRAE où elle poursuit ces travaux.

Chiara s'intéresse aux aspects quantitatifs des processus intracellulaires et à l'hétérogénéité cellulaire. Depuis 2020, elle est chercheuse postdoctorale au sein de l'équipe MuSE, où elle travaille sur la caractérisation de la mutagénèse en temps réel à l'échelle de la cellule unique chez Escherichia coli. Elle combine des approches expérimentales et théoriques, couvrant la microbiologie, la microfluidique et la microscopie, ainsi que le traitement d'images et l'analyse de données. En 2025, elle a obtenu un poste permanent d'ingénieure de recherche INRAE en microbiologie, microfluidique et vidéomicroscopie au sein de l'équipe MuSE.

Auparavant, Chiara a étudié la physique à l'Université de Turin (Italie), où elle a soutenu son mémoire de master en physique expérimentale du solide. Elle s'est ensuite orientée vers la biologie quantitative et a obtenu un doctorat en physique du Politecnico di Torino en 2019, portant sur le rôle de l'hétérogénéité cellulaire dans la régulation génique post-transcriptionnelle ainsi que dans la croissance des populations de cellules cancéreuses. Elle a mis au point des protocoles expérimentaux, des outils d'analyse d'images et de données, qu'elle a également adaptés à l'étude d'autres processus biologiques dans les cellules de mammifères : i) l'optimisation métabolique de la production de protéines thérapeutiques dans les cellules, ii) le trafic intracellulaire médié par les vésicules et iii) le criblage non invasif à haut débit de la croissance des populations cellulaires.

Magali est titulaire d'un diplôme d'ingénieure en biologie et a débuté sa carrière dans un laboratoire d'analyse. En 2006, elle s'est orientée vers la recherche en génétique microbienne et a obtenu un diplôme d'ingénieure.

Ses travaux de recherche antérieurs portent notamment sur la dynamique des chromosomes bactériens et la caractérisation d'une nouvelle hormone végétale. Depuis 2007, elle occupe un poste permanent à l'INRAE, au sein de l'unité de génétique microbienne qui a rejoint l'institut Micalis en 2010. De 2007 à 2020, au sein des équipes IFPC et ProCeD, elle a identifié et caractérisé fonctionnellement des complexes protéiques impliqués dans des processus cellulaires majeurs chez la bactérie modèle Gram-positive Bacillus subtilis, tels que le métabolisme de l'ADN, la sporulation et la morphogenèse, en utilisant diverses techniques comme l'interactomique, la robotique, la microscopie à épifluorescence et l'analyse de l'expression génique.

En 2020, Magali a rejoint l'équipe du MuSE pour étudier l'apparition de mutations de l'ADN chez les phages et E. coli, à l'échelle unicellulaire, et leur impact sur l'évolution et l'adaptation bactériennes. Pour ce faire, elle utilise des techniques de microfluidique, de microscopie à épifluorescence, de génétique microbienne et de biologie moléculaire.

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Mathieu est titulaire d'un doctorat en microbiologie, obtenu en 2013 sous la direction de François Cornet à l'Institut LMGM de Toulouse. Ses travaux portaient sur la région terminale du chromosome d'Escherichia coli, étudiée par marquage fluorescent pour la visualisation des loci. Il a démontré l'existence d'une dynamique très spécifique de cette région in vivo.

Intéressé par la dynamique globale du chromosome d'E. coli, Mathieu a ensuite effectué un postdoctorat au sein du laboratoire de Nancy Kleckner à l'Université Harvard, à Cambridge (États-Unis). Il y a étudié les fluctuations du nucléoïde par microscopie de fluorescence à haut débit, mettant en évidence un cycle de type « respiration » au sein du nucléoïde. Ces cycles d'expansion/compaction dépendent du degré de superhélicité du chromosome.

Depuis 2022, Mathieu est ingénieur de recherche au sein de l'équipe MuSE. Il travaille sur le taux de mutation chez les bactériophages et E. coli, en utilisant les méthodes à haut débit développées au laboratoire pour la visualisation des mutations.

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